После развала страны они получили чешское гражданство, Елена — при помощи коррумпированного главы МВД Чехии Станислава Гросса. В начале нулевых семья стала работать в оружейном бизнесе, одновременно с этим через Елену действиями Николая руководил глава в/ч 29155 ГРУ Андрей Аверьянов (тот самый, что причастен к атакам микроволновым излучением).
Небольшой доход не помешал Шапошниковым вести шикарный образ жизни и покупать формально недоступную недвижимость (чешские следователи говорят, что «их официальный доход не мог покрыть даже месячный счет за телефон»). Среди дорогих активов — купленная в 2009 году вилла «Елена» на острове Халкидики в Греции, куда Шапошниковы переехали и Чехию с тех пор почти не посещали. Но жили на вилле не только Николай с Еленой: туда регулярно приезжали сотрудники в/ч 29155. Часть визитов совпадает по времени с миссиями гэрэушников в регионе. Также Елена помогала ГРУ срывать не выгодные России поставки оружия.
Некоторое время назад парой заинтересовались чешские власти. Николай вскоре умер, распереживавшись из-за перспективы ареста. Елена утверждает, что ее преследуют за российские корни, а знакомства с разведчиками — сугубо личные или связанные с оружейным бизнесом. Но у женщины обнаружили российский паспорт с номером, типичным для сотрудников в/ч 29155. В 2015 году по этому паспорту она летала в Россию буквально на пару дней — по всей вероятности, тогда Владимир Путин награждал ее званием Героя России вместе с коллегами из ГРУ, участвовавшими во взрывах складов в Чехии и отравлении болгарского оружейника Емельяна Гебрева.
